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Software

Software: imodtkalign

imodtkalign

imodtkalign ist ein graphisches User-Interface (GUI) für die Alignment-Programme aus dem IMOD Software Paket von David Mastronarde am Boulder Laboratory for 3D Electron Microscopy of Cells. Mit imodtkalign können Bildstapel in Graustufen oder RGB mit mehreren Gigabyte Größe aligniert werden. Dazu wird eine Pipeline bereitgestellt, die mit Hilfe von ImageMagick temporäre, skalierte Kopien der Originalbilder anlegt und diese für das Berechnen des Alignments mit den IMOD-Programmen nutzt. Die gespeicherten Bildtransformationen werden dann genutzt, um aus den Originaldaten einen alignierten neuen Stapel mit der ursprünglichen Auflösung zu berechnen.

Dokumentation

Download zip-Archiv, enthält Skripte für Linux / Windows

 imodtkalign_image

 

imodtkalign unterliegt der GNU Public License GPL 

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